斑马荧光笔共有25种颜色，包括深色、浅色、荧光色、亲和色和清透色。深色包括朱红色、金色和棕色。煤烟蓝和品红，光色系包括绿色、深蓝色、灰色、紫色和红色，荧光系包括粉色、橙色、黄色、蓝绿色和蓝色，亲和系包括亮蓝、杏橙色、珊瑚粉、柠檬黄和深灰色，阳光系包括紫红色、圣诞金、柑橘绿、夏日绿和淡紫色。

斑马荧光笔在原有15种颜色的基础上又推出了两种新颜色，共有25种颜色供大家选择。经过不断创新，公众选择的空间也在不断扩大。而且不同的颜色可以自由组合，这样在做笔记的时候，也会让笔记变得清晰。

一般荧光笔都含有荧光剂。当它遇到紫外线时，会产生荧光效应，发出白光，从而使颜色看起来有耀眼的荧光。市面上也有无色荧光笔可以隐藏。书写后没有颜色，但被紫光照射后会显示书写的内容，这也是荧光笔的亮点之一。